Nagy evolúciós átmenetek

 
(Szathmáry Eörs, Scheuring István, Könnyű Balázs, Zachar István, Müller Viktor)
 
2017-es évfolyam
 
  Február 14. A nagy evolúciós átmenetek jellemzői, jelentőségük, áttekintés. A komplexitás növekedése az evolúciós során (Scheuring István) [pdf]
                        Hasznos szakirodalom: Carrol 2001 Nature   Szathmáry 2015 PNAS

  Február 21. Kémiai evolúció (Könnyű Balázs) [pdf]
 
Ezek egyenlőre a tavalyi anyagok
  Február 24. Felületi anyagcsere (Könnyű Balázs) [pdf]
  Március 2.   RNS világ (Szilágyi András) [pdf]
                        Hasznos szakirodalom:[Kun_et_al]
  Március 9. Átmenet az első sejtek felé, genetikai kód, bakteriális szex (Scheuring István) [pdf]
  Március 16. Az eukarióta átmenet, meiotikus szex (Scheuring István) [pdf]
  Március 30. Genomikus konfliktusok, a soksejtűség eredete (Scheuring István) [pdf]
                     Hasznos szakirodalom: [Miller_2010]
  Április 6. Az immunrendszer evolúciója (Müller Viktor) [pdf]
  Április 13. Az állati társadalmak kialakulása (Scheuring István) [pdf]
  Április 20. Mutualizmus és szimbiózis (Boza Gergely) [pdf]
                     Hasznos szakirodalom:[Jones_etal_2015]
  Április 27. Az emberi nyelv eredete (Zachar István) [pdf] és egy videó kommunikáló robotokkal: [video]
  Május 4. Az emberi utódgondozás és együttműködés (Scheuring István) [pdf],
                     Hasznos segédanyag: [A menopauza evolúciója]
  Május 11. Az emberi együttműködés eredete (Scheuring István) [pdf]
 
  A vizsgán használható ábrák:[ppt]
  Tételjegyzék:[pdf]
 
 
Korábbi évek anyagai:
 
  1. Prebiotikus szintézisek (Könnyű Balázs) [pdf]
  2. Felületi anyagcsere (Könnyű Balázs) [pdf]
  3. RNS rátermettségtájképek (Kun Ádám)
  4. RNS világ és az első és második hibaküszöb (Kun Ádám)
  5. Genetikai kód evolúciója (Kun Ádám)
  6. Nyelv evolúciója (Kun Ádám)
  7. Immunitás és evolúciós (Müller Viktor) [pdf]
  8. Mutualizmus és szinbiózis (Boza Gergely) [pdf]
  9. Allati társadalmak (Scheuring István) [pdf]
  10. Az emberi együttműködés (Scheuring István) [pdf] Brosnan et al 2010; Melis et al 2010
  11. Replikátorok (Zachar István)

 

  • A nyelv eredete (Zachar István) [pptx]
  • RNS rátermettségtájképek (Kun Ádám) [pdf]

2011/2012-es évfolyam

Hard problems of the origin of life [pdf]
Dynamical coexistence of molecules [ppt]
On the origin of the genetic code [pdf]
Evolution before genes (Vasas Vera doktori védésének diái) [pdf]

2010/2011-es évfolyam

Tételek

  • Kémiai evolúció, Miller, Gánti chemoton
  • rendszerkémia, formóz reakció, Szostak Science cikk protosejt
  • GARD modell és Doron matrix
  • Reduktív citromsavciklus, Wächtershäuser
  • von Kiedrowski replikator
  • Hibaküszöb, Eigen
  • Hiperciklus. paraziták térben explicit hiperciklus szimuláció, Hogeweg spirálkarok
  • Térbeli szelekció a hatékonyabb replikázra
  • Sztochasztikus korrektor modell
  • Replikátorok osztályozása, Reza Ghadiri protein replikáció
  • Qbéta replikáz, RNS világ replikáz problémák
  • Lathe és a Hold, Chrisantha Fernando es a hosszú szálak
  • Ribozimek in vitro szelekciója, aptamerek és aminosavak, ribozim és diffúzió limitáció. (Szathmáry 1990. Nature 344:115)
  • Genetikai kód eredete, szintetázok, LUCA, kód mintázatai, eltérések, evolúció mechanizmusai
  • Kódoló koenzim fogantyú

Szathmáry E. and Maynard Smith, J. (1995) The major evolutionary transitions. Nature 374: 227-232
Czárán T. and Szathmáry E. (2000) Coexistence of metabolically co-operating replicators in a cellular automaton: the importance of space without mesoscopic structure. In: Dieckmann, U., Law, R. & Metz, J.A.J. (eds.) The Geometry of Ecological Interactions: Simplifying Spatial Complexity, pp. 116-134, IIASA and Cambridge University Press.
Szathmáry E. 2000. The evolution of replicators.Phil.Trans. R. Soc. Lond. B 355, 1669-1676
Vasas V., Szathmáry E., Mauro, S. 2010. Lack of evolvability in self-sustaining autocatalytic networks: A constraint on the metabolism-first path to the origin of life. PNAS DOI:10.1073/pnas.0912628107
Szabó P., Scheuring I., Czárán T. and Szathmáry E. (2002) In silico simulations reveal that replicators with limited dispersal evolve towards higher efficiency and fidelity. Nature 420:340-344
On the origin of the genetic code (ppt)
RNS világ, hibaküszöb (ppt)
Hard problems of the origin of life (ppt)

2009/2010-es évfolyam

Tételek

  • 1. Az élet keletkezése: Kémiai evolúció, Miller-kísérletek, autokatalízis, formóz reakció, Eigen-modell, GARD, hiperciklus, kooperáció, von Kiedrowski, sztochasztikus korrektor
  • 2. Az eukarióta sejt eredete: filogenetika, műtermékek, paralóg gyökereztetés, mitokondriumok és plasztiszok erdete, másodlagos plasztiszok, membrán topobiológia
  • 3. A többsejtűek eredete: epigenetikai öröklődés rokonszelekció mixobaktériumok és nyálkagombák aggregációs és növekedéses többsejtűség munkamegosztás
  • 4. A kambriumi robbanás: az Ediacara kétdimenziós fauna. Ökológiai, egyedfejlődlési és genetikai elképzelések. Fontos adaptációk: a látás és az asszociatív tanulás
  • 5. Az ember eredete: Az adaptív csomag, a neandervölgyiek, az emberi beszéd fontossága, véges állapotú és kifejezés-szerkezeti nyelvtanra alapozott kísérletek

2008/2009-es évfolyam

Tételek

2006/2007-es évfolyam

1. Replikátor, versengés

Szathmáry E. (2006) The origin of replicators and reproducers. Phil. Trans. R. Soc. B 361: 1761-1776

2. Evolúciós egység

3. Fraternális egalitarianus, nagy átmenetek

Szathmáry E. and Maynard Smith, J. (1995) The major evolutionary transitions. Nature 374: 227-232

4. Metabolizmus, hiperciklus. sztochasztikus korrektor modell

Szathmáry E., Santos, M. and Fernando, C. (2005) Evolutionary potential and requirements for minimal protocells. Top Curr Chem 259: 167-211
Czárán T. and Szathmáry E. (2000) Coexistence of metabolically co-operating replicators in a cellular automaton: the importance of space without mesoscopic structure. In: Dieckmann, U., Law, R. & Metz, J.A.J. (eds.) The Geometry of Ecological Interactions: Simplifying Spatial Complexity, pp. 116-134, IIASA and Cambridge University Press.

5. Sejtautomata és reakció diffúzió

Scheuring I., Czárán T., Szabó P., Károlyi Gy. and Toroczkai Z. (2003) Spatial models of prebiotic evoltion: soup before pizza? Origins of Life and Evolution of the Biosphere 33: 319-355
Szabó P., Scheuring I., Czárán T. and Szathmáry E. (2002) In silico simulations reveal that replicators with limited dispersal evolve towards higher efficiency and fidelity. Nature 420:340-344

6. Genetikai kód kialakulasa, mintazatai

Knight, R.D., Freeland, S.J. and Landweber, L.F. (1999) Selection, history and chemistry: the three faces of the genetic code. TIBS 24:241-247
Szathmáry E. (1999) The origin of the genetic code. TIG 15(6): 223-229

7. Ribozim termelés

8. Rendszerkémia, infrabiológia

Szathmáry E. (2005) In search of the simplest cell. Nature 433:469-470