Nagy evolúciós átmenetek
Március 9. Átmenet az első sejtek felé, genetikai kód, bakteriális szex (Scheuring István) [pdf]
Március 16. Az eukarióta átmenet, meiotikus szex (Scheuring István) [pdf]
Március 30. Genomikus konfliktusok, a soksejtűség eredete (Scheuring István) [pdf]
Április 6. Az immunrendszer evolúciója (Müller Viktor) [pdf]
Április 13. Az állati társadalmak kialakulása (Scheuring István) [pdf]
Április 20. Mutualizmus és szimbiózis (Boza Gergely) [pdf]
Április 27. Az emberi nyelv eredete (Zachar István) [pdf] és egy videó kommunikáló robotokkal: [video]
Május 4. Az emberi utódgondozás és együttműködés (Scheuring István) [pdf],
Május 11. Az emberi együttműködés eredete (Scheuring István) [pdf]
- Prebiotikus szintézisek (Könnyű Balázs) [pdf]
- Felületi anyagcsere (Könnyű Balázs) [pdf]
- RNS rátermettségtájképek (Kun Ádám)
- RNS világ és az első és második hibaküszöb (Kun Ádám)
- Genetikai kód evolúciója (Kun Ádám)
- Nyelv evolúciója (Kun Ádám)
- Immunitás és evolúciós (Müller Viktor) [pdf]
- Mutualizmus és szinbiózis (Boza Gergely) [pdf]
- Allati társadalmak (Scheuring István) [pdf]
- Az emberi együttműködés (Scheuring István) [pdf]
- Replikátorok (Zachar István)
2011/2012-es évfolyam
Hard problems of the origin of life [pdf]
Dynamical coexistence of molecules [ppt]
On the origin of the genetic code [pdf]
Evolution before genes (Vasas Vera doktori védésének diái) [pdf]
2010/2011-es évfolyam
- Kémiai evolúció, Miller, Gánti chemoton
- rendszerkémia, formóz reakció, Szostak Science cikk protosejt
- GARD modell és Doron matrix
- Reduktív citromsavciklus, Wächtershäuser
- von Kiedrowski replikator
- Hibaküszöb, Eigen
- Hiperciklus. paraziták térben explicit hiperciklus szimuláció, Hogeweg spirálkarok
- Térbeli szelekció a hatékonyabb replikázra
- Sztochasztikus korrektor modell
- Replikátorok osztályozása, Reza Ghadiri protein replikáció
- Qbéta replikáz, RNS világ replikáz problémák
- Lathe és a Hold, Chrisantha Fernando es a hosszú szálak
- Ribozimek in vitro szelekciója, aptamerek és aminosavak, ribozim és diffúzió limitáció. (Szathmáry 1990. Nature 344:115)
- Genetikai kód eredete, szintetázok, LUCA, kód mintázatai, eltérések, evolúció mechanizmusai
- Kódoló koenzim fogantyú
Szathmáry E. and Maynard Smith, J. (1995) The major evolutionary transitions. Nature 374: 227-232
Czárán T. and Szathmáry E. (2000) Coexistence of metabolically co-operating replicators in a cellular automaton: the importance of space without mesoscopic structure. In: Dieckmann, U., Law, R. & Metz, J.A.J. (eds.) The Geometry of Ecological Interactions: Simplifying Spatial Complexity, pp. 116-134, IIASA and Cambridge University Press.
Szathmáry E. 2000. The evolution of replicators.Phil.Trans. R. Soc. Lond. B 355, 1669-1676
Vasas V., Szathmáry E., Mauro, S. 2010. Lack of evolvability in self-sustaining autocatalytic networks: A constraint on the metabolism-first path to the origin of life. PNAS DOI:10.1073/pnas.0912628107
Szabó P., Scheuring I., Czárán T. and Szathmáry E. (2002) In silico simulations reveal that replicators with limited dispersal evolve towards higher efficiency and fidelity. Nature 420:340-344
On the origin of the genetic code (ppt)
RNS világ, hibaküszöb (ppt)
Hard problems of the origin of life (ppt)
2009/2010-es évfolyam
- 1. Az élet keletkezése: Kémiai evolúció, Miller-kísérletek, autokatalízis, formóz reakció, Eigen-modell, GARD, hiperciklus, kooperáció, von Kiedrowski, sztochasztikus korrektor
- 2. Az eukarióta sejt eredete: filogenetika, műtermékek, paralóg gyökereztetés, mitokondriumok és plasztiszok erdete, másodlagos plasztiszok, membrán topobiológia
- 3. A többsejtűek eredete: epigenetikai öröklődés rokonszelekció mixobaktériumok és nyálkagombák aggregációs és növekedéses többsejtűség munkamegosztás
- 4. A kambriumi robbanás: az Ediacara kétdimenziós fauna. Ökológiai, egyedfejlődlési és genetikai elképzelések. Fontos adaptációk: a látás és az asszociatív tanulás
- 5. Az ember eredete: Az adaptív csomag, a neandervölgyiek, az emberi beszéd fontossága, véges állapotú és kifejezés-szerkezeti nyelvtanra alapozott kísérletek
2008/2009-es évfolyam
- Az evolúció fényében
- Szathmáry E. and Maynard Smith, J. (1995) The major evolutionary transitions. Nature 374: 227-232
- Szathmáry E. (2006) The origin of replicators and reproducers. Phil. Trans. R. Soc. B 361: 1761-1776
- Az RNS világ, hibaküszöb [ppt]
- Scheuring I., Czárán T., Szabó P., Károlyi Gy. and Toroczkai Z. (2003) Spatial models of prebiotic evoltion: soup before pizza? Origins of Life and Evolution of the Biosphere 33: 319-355
- Looking for the Cradle of Life [ppt]
- A genetikai kód eredete [ppt]
- Az élet eredetének kísérleti eredményei [ppt]
- On the origin and evolution of some genetic systems [ppt]
- (Super)systems and selection dynamics [ppt]
- The emergence and importance of compartment models [ppt]
- The Origin of Life [ppt]
2006/2007-es évfolyam
1. Replikátor, versengés
Szathmáry E. (2006) The origin of replicators and reproducers. Phil. Trans. R. Soc. B 361: 1761-1776
2. Evolúciós egység
3. Fraternális egalitarianus, nagy átmenetek
Szathmáry E. and Maynard Smith, J. (1995) The major evolutionary transitions. Nature 374: 227-232
4. Metabolizmus, hiperciklus. sztochasztikus korrektor modell
Szathmáry E., Santos, M. and Fernando, C. (2005) Evolutionary potential and requirements for minimal protocells. Top Curr Chem 259: 167-211
Czárán T. and Szathmáry E. (2000) Coexistence of metabolically co-operating replicators in a cellular automaton: the importance of space without mesoscopic structure. In: Dieckmann, U., Law, R. & Metz, J.A.J. (eds.) The Geometry of Ecological Interactions: Simplifying Spatial Complexity, pp. 116-134, IIASA and Cambridge University Press.
5. Sejtautomata és reakció diffúzió
Scheuring I., Czárán T., Szabó P., Károlyi Gy. and Toroczkai Z. (2003) Spatial models of prebiotic evoltion: soup before pizza? Origins of Life and Evolution of the Biosphere 33: 319-355
Szabó P., Scheuring I., Czárán T. and Szathmáry E. (2002) In silico simulations reveal that replicators with limited dispersal evolve towards higher efficiency and fidelity. Nature 420:340-344
6. Genetikai kód kialakulasa, mintazatai
Knight, R.D., Freeland, S.J. and Landweber, L.F. (1999) Selection, history and chemistry: the three faces of the genetic code. TIBS 24:241-247
Szathmáry E. (1999) The origin of the genetic code. TIG 15(6): 223-229
7. Ribozim termelés
8. Rendszerkémia, infrabiológia
Szathmáry E. (2005) In search of the simplest cell. Nature 433:469-470