Zachar István szakmai honlapja

 

Tudományos fokozat:  Ph.D.  
Munkahely:  Növényrendszertani, Ökológiai és Elméleti Biológiai Tanszék
Budapest 1117 Pázmány Péter sétány 1/C
 
Beosztás:  tudományos munkatárs
Telefon:  +36 1 372-2500 / 1707
Fax:  +36 1 381 2188
Email: 
   
ResearchGate:   
Google Scholar:   
ResearcherID:  P-5101-2015  
MTMT:  10018723  
StackExchange:  profile for István Zachar on Stack Exchange, a network of free, community-driven Q&A sites  

Kutatási területek

Prebiotika: élet keletkezése, korai templátok evolúciója, koegzisztenciája;

Evolúció: eukarióták eredete, mitokondrium eredete, sejtmag kialakulása; nagy evolúciós átmenetek (Major Evolutionary Transitions)

Kultúra: emberi nyelv eredete és korai evolúciója, kulturális evolúció, nyelvtan és szintaxis evolúciója;

Tanulás: emberi kognitív folyamatok, tanulás modellezése, insight tanulás, neurális modellek;

 

Szakdolgozati témák

BSc, MSc témák

  • A mitokondrium eredete: az endoszimbionta baktérium integrálódása és fennmaradása az Archaea gazdában. Ökológiai-evolúciós modellezés, különböző mitokondrium eredet-elméletek tesztelése a modellel.

  • A fagocitózis eredete ősbaktériumokban: a fagocitózis energetikája és genetikai háttere, megvalósíthatósága Archaeában. Irodalmazás, bioenergetikai adatok kutatása, ökológiai-evolúciós modellezés, biokémiai utak modellezése.

  • A prokarióta sejtváz eredete: a citoszkeleton genetikai háttere, fehérjéinek funkciói, kialakulásának ideje. Irodalmazás, genomikai és proteomikai adatok kutatása, filogenetikai analízis.

  • A nagy evolúciós átmenetek trendje: a nagy átmenetek időbeli trendjének vizsgálata és modellezése, az élet kialakulásától az eukarióta sejt megjelenésén át az emberi nyelv eredetéig. Metaanalízis, filogenetika, modellezés.

 

Oktatási tevékenység

 

Publikációk

Legfontosabb publikációk

2018 Zachar, I., Szilágyi, A., Számadó, S., & Szathmáry, E. Farming the mitochondrial ancestor as a model of endosymbiotic establishment by natural selection. Proceedings of the National Academy of Sciences, 115, E1504-E1510. doi: 10.1073/pnas.1718707115. PDF
Access the recommendation on F1000Prime

2017 Zachar, I. & Szathmáry, E. Breath-giving cooperation: critical review of origin of mitochondria hypotheses. Biology Direct, 12(1), doi: 10.1186/s13062-017-0190-5. PDF

2017 Szilágyi, A., Zachar, I., Scheuring, I.; Kun, Á.; Könnyű, B. & Czárán, T. Ecology and evolution in the RNA World: Dynamics and stability of prebiotic replicator systems. Life, 7. doi: 10.3390/life7040048. PDF

2016 Szilágyi, A., Zachar, I., Fedor, A., de Vladar, H. P. & Szathmáry, E. Breeding novel solutions in the brain: A model of Darwinian neurodynamics. F1000Research, 5. doi: 10.12688/f1000research.9630.1.

2015 Kun, Á., Szilágyi, A., Könnyű, B., Boza, G., Zachar, I. & Szathmáry, E. The dynamics of the RNA world: insights and challenges. Annals of the New York Academy of Sciences 1341(1), 75–95. doi: 10.1111/nyas.12700. PDF

2011 Zachar, I. The feasibility of segmentation of protolanguage. Interaction Studies 12(1), 1–35. doi: 10.1075/is.12.1.01zac. PDF

2010 Zachar, I. & Szathmáry, E. A new replicator: A theoretical framework for analyzing replication. BMC Biology 8(21), 21. doi: 10.1186/1741-7007-8-21. PDF

További cikkek

2017 Fedor, A., Zachar, I., Szilágyi, A., Öllinger, M., de Vladar, H. P. & Szathmáry, E. Cognitive architecture with evolutionary dynamics solves insight problem. Frontiers in Psychology, 8(427). doi: 10.1016/j.jtbi.2015.06.047. PDF

2016 de Vladar, H. P., Fedor, A., Szilágyi, A., Zachar, I. & Szathmáry, E. An attractor network-based model with Darwinian dynamics. Proceedings of the 16th Annual Conference on Genetic and Evolutionary Computation (GECCO '16). doi: 10.1145/2908961.2931672.

2015 Vasas, V., Fernando, C., Szilágyi, A., Zachar, I., Santos, M. and Szathmáry, E. Primordial evolvability: Impasses and challenges. Journal of Theoretical Biology, 381, doi: 10.1016/j.jtbi.2015.06.047. PDF

2015 Kun, Á., Szilágyi, A., Könnyű, B., Boza, G., Zachar, I. and Szathmáry, E. The dynamics of the RNA world: insights and challenges. Annals of the New York Academy of Sciences 1341(1), 75–95. doi: 10.1111/nyas.12700. PDF

2013 Szilágyi, A., Zachar, I. and Szathmáry, E. Gause’s principle and the effect of resource partitioning on the dynamical coexistence of replicating templates. PLoS Computational Biology 9(8), e1003193. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003193. PDF

2011 Zachar, I. The feasibility of segmentation of protolanguage. Interaction Studies 12(1), 1–35. doi: 10.1075/is.12.1.01zac. PDF

2011 Zachar, I., Fedor, A. and Szathmáry, E. Two different template replicators coexisting in the same protocell: Stochastic simulation of an extended chemoton model. PLoS ONE 6(7), e21380. doi: 10.1371/journal.pone.0021380. PDF

2010 Zachar, I. and Szathmáry, E. A new replicator: A theoretical framework for analyzing replication. BMC Biology 8(21), 21. doi: 10.1186/1741-7007-8-21. PDF

Könyvfejezetek

2013 Zachar, I., Kun, Á., Fernando, C. and Szathmáry, E. Replicators: From molecules to organism. In: Kernbach, S. (ed.) Handbook of collective robotics: Fundamentals and challenges., ch. 13. Pan Stanford Publishing, Singapore, p. 473–501. doi: 10.13140/RG.2.1.2884.3606. PDF

2007 Szathmáry, E., Szatmáry, Z., Ittzés, P., Orbán, G., Zachar, I., Huszár, F., Fedor, A., Varga, M. and Számadó, Sz. In silico evolutionary developmental neurobiology and the origin of natural language. In: Lyon, C., Nehaniv, C. L. and Cangelosi, A. (ed.) Emergence of communication and language., ch. 8. Springer-Verlag New York, Inc., New York, p. 151–187. doi: 10.1007/978-1-84628-779-4_8. PDF

Tézisek

2011 Zachar, I. Replicator Formalism. A general account of replication. PhD diplomamunka, Eötvös Loránd University, Department of Plant Systematics, Ecology and Theoretical Biology, Budapest. pp. 147. doi: 10.13140/RG.2.1.3981.5209. PDF

2004 Zachar, I. Harmadidőszaki Myliobatoideák elkülönítése [Identifying Tertiary Myliobatoids; in Hungarian]. MSc diplomamunka, Eötvös Loránd University, Department of Paleontology, Budapest. pp. 49. doi: 10.13140/10.13140/RG.2.1.2687.7520. PDF